[Перевод] Червь, которого не может взломать ни один компьютер

Когда я запустила первую симуляцию червя, ветра Санта-Аны дули уже сильно. Я не хакер, но это было просто: открываешь оболочку терминала, вставляешь команды из GitHub и наблюдаешь за бегущим по экрану каскадом символов. Совсем как в фильмах. Пока я искала в пролетающем перед глазами коде узнаваемые слова — neuron , synapse — ко мне подошёл друг, чтобы пойти со мной на ужин. «Секунду. Я тут прогоняю на компьютере червя», — крикнула я ему из офиса. В корейском ресторане царил хаос: ветер клонил пальмы и гонял магазинные тележки по парковке. Атмосфера казалась сюрреалистичной, похожей на подкаст, проигрываемый с удвоенной скоростью. «Чем ты там занимаешься? Киберпреступлениями?», — спросил друг. Я попробовала ему объяснить: «Нет, не червя типа Stuxnet. Настоящего живого червя». Когда я добралась домой, было уже темно, а в Альтадене уже загорались первые искорки пожаров. На моём ноутбуке меня ждал червь в объёмной пиксельной коробке. Заострённый с обоих концов, он висел в тумане из частиц, странно прямой и неподвижный. Разумеется, он никогда не был живым. Но мне он казался мертвее мёртвого. «Браво», — сказал мне Стивен Ларсон, когда я написала ему тем же вечером, — «вы добились состояния «hello world» в симуляции».

https://habr.com/ru/companies/ruvds/articles/896824/

#нематоды #c_elegans #моделирование_биологических_систем #openworm #ruvds_перевод

Червь, которого не может взломать ни один компьютер

Когда я запустила первую симуляцию червя, ветра Санта-Аны дули уже сильно. Я не хакер, но это было просто: открываешь оболочку терминала, вставляешь команды из GitHub и наблюдаешь за бегущим по экрану...

Хабр
The Worm That No Computer Scientist Can Crack

One of the simplest, most over-studied organisms in the world is the C. elegans nematode. For 13 years, a project called OpenWorm has tried—and utterly failed—to simulate it.

WIRED
Study reveals how RNA travels between cells to control genes across generations

RNA-based medicines are one of the most promising ways to fight human disease, as demonstrated by the recent successes of RNA vaccines and double-stranded RNA (dsRNA) therapies. But while health care providers can now successfully develop drugs that use dsRNA to accurately target and silence disease-causing genes, a major challenge remains: getting these potentially life-saving RNA molecules into cells efficiently.

Phys.org

[Перевод] Эти крошечные черви отвечают как минимум за четыре Нобелевских премии

Когда учёные получают Нобелевскую премию по физиологии или медицине, они обычно благодарят семью и коллег, возможно, свои университеты или тех, кто финансировал их исследования. В этом году молекулярный биолог Гэри Рувкун, принимая самую престижную награду в своей карьере, потратил несколько минут на то, чтобы похвалить своего подопытного: крошечного червя по имени Caenorhabditis elegans, которого он назвал «крутым» [badass]. «Никто никогда не думал использовать этот термин для червя», — сказал он на пресс-конференции. «Мы утверждаем себя сейчас, а я утверждал это ещё до получения Нобелевской премии». Это не первая встреча червя с международной звездой, и это не первый случай, когда C. elegans благодарят за помощь в работе, отмеченной наградами. Награда доктора Рувкуна стала уже четвёртой Нобелевской премией, полученной в результате исследований C. elegans, что подтверждает огромную роль этого скромного почвенного червя в научных открытиях.

https://habr.com/ru/articles/855604/

#черви #C_elegans #Caenorhabditis_elegans

Эти крошечные черви отвечают как минимум за четыре Нобелевских премии

C. elegans — это «мечта экспериментатора», — сказал один из учёных. Когда учёные получают Нобелевскую премию по физиологии или медицине, они обычно благодарят семью и коллег, возможно, свои...

Хабр
Different means to the same end: How C. elegans protects its chromosomes

University of Michigan researchers have discovered that a worm commonly used in the study of biology uses a set of proteins unlike those seen in other studied organisms to protect the ends of its DNA.

Phys.org

My teenager: “Ah yes, I remember the C. elegans Twitter debacle.”

Life in the future can be very silly sometimes.

#teenagers #c_elegans #modelOrganisms #socialmedia

Study finds wild #nematode worms learn to avoid harmful #bacteria—and their offspring #inherit this knowledge.

#Pseudomonas #C_elegans #RNA #Pv1

https://phys.org/news/2024-03-wild-nematode-worms-bacteria-offspring.html

Study finds wild nematode worms learn to avoid harmful bacteria—and their offspring inherit this knowledge

The nematode worm C. elegans will stay away from dangerous bacteria in its environment when exposed to certain bacterial RNAs—and can transmit that learned behavior to future generations. A team led by Coleen Murphy at Princeton University report these findings in a new study, published in the journal PLOS Genetics.

Phys.org
Low-pH-dependent RNA binding and oligomerization of SID-1 transmembrane family proteins: Implications for RNA transport

In C. elegans, the protein SID1 plays a crucial role in the systemic RNA interference process by facilitating the transport of exogenous double-stranded RNA into the cytoplasm. Previously, Chen-Yu Zhang's group has already demonstrated that intact plant miRNA found in dietary sources can be absorbed through the mammalian digestive system and mediate cross-kingdom gene regulation.

Phys.org
Researchers reveal composition and regulatory mechanism of the nucleolar vacuole in C. elegans

A team led by Prof. Guang Shouhong and Prof. Feng Xuezhu from the University of Science and Technology (USTC) of the Chinese Academy of Sciences (CAS) revealed, for the first time, the composition and regulatory mechanism of the nuclear vacuole in C. elegans. The study was published in Cell Reports.

Phys.org
Researchers discover tissue-specific protection against protein aggregation

Researchers from the Babraham Institute, UK, and the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) have identified a backup mechanism of protein quality control which prevents the toxic effects of protein aggregation in specific tissues when normal methods of molecular monitoring fail. Their work has been published in PLoS Biology .

Phys.org