GQE-Le Moulon⏩Soutenance de #HDR de Mélisande Blein-Nicolas - GQE
📆 Jeudi 4 décembre 2025 à 13h
➡️ La relation génotype-phénotype : des approches réductionnistes aux approches holistiques basées sur la #protéomique
Retour en images sur la Fête de la Science de l'IDEEV
L'IDEEV a fêté la science du 3 au 5 octobre, sur le Village des Sciences de l’ENS et dans ses locaux à Gif-sur-Yvette. Trois jours de rencontres, jeux, ateliers, échanges entre les personnels des 3 unités de l’IDEEV et un public de tout âge très curieux.
Merci au public nombreux et à toute l'équipe d'animation 🙏
⏩ https://www.ideev.universite-paris-saclay.fr/news/
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24-month Postdoctoral Fellow Position in Plant Genomics and Bioinformatics at @lemoulon
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24-month Postdoctoral Fellow Position in Plant Genomics and Bioinformatics at GQE-Le Moulon
We are seeking a highly motivated and experienced postdoctoral fellow to join our research team at the Institute Jean Pierre Bourgin for Plant Sciences and the laboratory Quantitative Genetics and Evolution – Le Moulon (GQE), located in the southern vicinity of Paris. The successful candidate will be part of the vibrant scientific environment of the Saclay Plant Science (SPS) community and will collaborate closely with researchers from the Institute for Plant Sciences – Paris Saclay (IPS2).
Soutenance de thèse d'Annaïg de Walsche GQE-Le Moulon
📅 Jeudi 10 avril 2025 à 14 h
"Développement de méthodes statistiques pour la méta-analyse d’études d’association pangénomique, applications en génétique des plantes"
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Développement de méthodes statistiques pour la méta-analyse d'études d'association pangénomique, applications en génétique des plantes
Thèse menée sous la direction de Tristan Mary-Huard (MIA Paris Saclay, GQE Le Moulon) et Alain Charcosset (GQE Le Moulon). Le jury sera composé de : David Causeur, Professeur - Institut Agro, Université Rennes, CNRS (Rapporteur et Examinateur) Pierre Neuvial, Directeur de Recherche - CNRS, Institut Mathématiques de Toulouse (Rapporteur et Examinateur) Hugues Aschard, Directeur de Recherche - Institut Pasteur, Sorbonne Université (Examinateur) Mathilde Causse, Directrice de Recherche - INRAE, UMR GAFL, Avignon Université (Examinatrice) Andrea Rau, Directrice de Recherche - INRAE, UMR GABI, Université Paris-Saclay, AgroParisTech (Examinatrice) Résumé : Les études d’association pangénomiques (GWAS) permettent d’identifier les régions génomiques associées aux caractères phénotypiques.En génétique végétale, ces GWAS aident à identifier les facteurs génétiques influant des caractères agronomiques essentiels, tels que le rendement, la résistance aux maladies ou la tolérance aux stress environnementaux. Cependant, les GWAS présentent des limites importantes, notamment en termes de puissance statistique car elles analysent des millions de marqueurs génétiques pour un nombre relativement réduit d’individus. De plus, les approches GWAS standard sont généralement limitées à l’étude des associations avec un seul caractère à la fois, ce qui restreint leur capacité à appréhender l’architecture génétique complexe sous-jacente à plusieurs caractères. En génétique humaine, la méta-analyse a été efficacement utilisée pour intégrer les résultats de plusieurs études GWAS et surmonter les limites des approches standards, en permettant d’une part d’améliorer la puissance statistique et d’autre part d’étudier les associations entre plusieurs caractères. Malgré ce potentiel, la méta-analyse n’a été que très peu exploitée en génétique végétale. Dans cette thèse, nous présentons les raisons pour rendant les méthodes existantes de méta-analyse inappropriées aux applications en génétique végétale et introduisons des nouvelles méthodes de méta-analyse adaptées à trois différents contextes clés. Premièrement, nous proposons une méthode de méta-analyse pour étudier les interactions gène-environnement, qui jouent un rôle crucial dans la relation génotype-phénotype chez les plantes. Deuxièmement, nous présentons une approche de méta-analyse pour détecter les variants pléiotropes, qui influencent plusieurs caractères phénotypiques et permettent de mieux comprendre les voies génétiques. Troisièmement, nous introduisons une nouvelle stratégie permettant de détecter les variants génétiques associés à des groupes de caractères moléculaires, tels que l’expression de gènes ou l’abondance de protéines. Les méthodologies développées dans cette thèse reposent sur des modèles à variables latentes, permettant une modélisation flexible des effets génétiques dans différents contextes. En abordant les principales limites des méta-analyses, ce travail offre de nouvelles méthodes statistiques pour les études d’association en génétique végétale, permettant des investigations plus approfondies de l’architecture génétique des caractères complexes.
"Une petite histoire du phénotype et de sa relation avec le génotype"
Bien que les notions de phénotype et de "relation génotype-phénotype" fassent partie du vocabulaire quotidien des biologistes, elles ne sont pas toujours bien comprises et sont parfois mal utilisées.
Dans un article de la revue du CNRS "Histoire de la recherche contemporaine", Dominique de Vienne ( #IDEEV #GQELeMoulon) retrace l’histoire de ces notions. Il rappelle d’abord que la question originelle était celle de la relation entre une variation génotypique et une variation phénotypique.
✅ En savoir plus : https://moulon.inrae.fr/news/2025/02/une-petite-histoire-du-ph%C3%A9notype-et-de-sa-relation-avec-le-g%C3%A9notype/
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Olivier Langellaa new @typst template for slide presentations is available at https://typst.app/?q=gqe&template=gqe-lemoulon-presentation&version=0.0.5
It was developed for #HCERES in our lab #GQE at #IDEEV, but it is suitable for anyone as everything can be customized.
a bit of documentation here :
https://forgemia.inra.fr/gqe-moulon/gqe-presentation
