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L'IDEEV participe à la Journée Internationale de la Biodiversité

L’IDEEV est fier de participer à la journée internationale de la biodiversité   , jeudi 22 mai 2025. De nombreuses thématiques de recherche de l’IDEEV sont directement liées à l’étude de la biodiversité avec, comme fil conducteur, l’origine, le maintien et l’évolution de la biodiversité à différents niveaux d’intégration du vivant. Ceci implique en particulier l’étude des adaptations aux changements environnementaux, qu’ils soient d’origine anthropique ou non. Les nombreux personnels de l’IDEEV travaillent sur l’ensemble du monde du vivant, produisent des documents et participent à des événements grand public dont voici quelques exemples :

Interactions among hosts, microorganisms and parasitoids

Parasitoids rely on other insects for the development of their offspring. They oviposit in or on a host, which is progressively consumed during larval development. Both parasitoids and their hosts harbour diverse microbial symbionts that may influence the outcome of their interaction and contribute to the evolutionary arms race between them. Many parasitoids are associated with symbiotic viruses that are injected into the host during oviposition and suppress the host’s immune responses. In contrast, several herbivorous hosts carry bacterial symbionts that play various important functions, including resistance to parasitism. In this work, I aim to better understand how microorganisms influence and are influenced by host-parasitoid interactions.

Résister au mouvement anti-science américain

Défendons les sciences Des scientifiques du laboratoire GQE-Le Moulon/IDEEV montent au créneau et donnent des pistes sur comment résister au mouvement anti-science en cours aux Etats-Unis. Ils ont écrit un article sur ce sujet publié dans HAL. Pour le lire: en français ( https://hal.science/hal-05021729   ) En anglais: ( https://hal.science/hal-05021727   )

Stand-Up for Science Paris-Sud !

Une chaine peertube pour partager des vidéos et des podcasts visant à la défense de la recherche, des sciences et des libertés académiques

Ma manip en photos : Malena Sibaja leyton, ingénieure d'études au pôle écologie d'EGCE

Je m’appelle Malena Sibaja Leyton, j’ai mené mon projet de thèse (2021-2024) sous la supervision de Fabrice Requier et de Paul-André Calatayud au sein du pôle écologie du laboratoire EGCE   , où j’ai actuellement un poste d’ingénieure d’études. J’ai précédemment obtenu un diplôme de master en Écophysiologie, écologie et éthologie au sein de l’Université de Strasbourg. Mon objectif était d’étudier les impacts climatiques, paysagers et de gestion sur les pertes de colonies d’abeilles mellifères et abeilles sans dard en Amérique Latine et en Afrique subsaharienne (Kenya).

Il travaille à l'IDEEV : Daniel Berveiller, ingénieur de recherche à ESE

Il passe une grande partie de son temps dans les airs, au-dessus de la canopée, mais il n’en a pas moins les pieds sur terre ! Daniel Berveiller, ingénieur de recherche au laboratoire Ecologie Société Evolution   , est le nouveau portrait de l’IDEEV. Daniel Berveiller, vous êtes ingénieur de recherche au CNRS au laboratoire ESE de l’IDEEV. En quoi consiste votre travail ? J’ai plusieurs casquettes. Mon rôle principal est celui de responsable de la plateforme de Barbeau   (photos à droite et ci-dessous), station de recherche en milieu naturel, localisée en forêt domaniale de Barbeau, proche de Fontainebleau. J’y assure, en tant que Principal Investigator, la coordination des activités de monitoring dans le cadre de l’Infrastructure de Recherche européenne ICOS   .

Stand-up for science Paris-Saclay

Sciences et libertés académiques : où en est-on ? Dans le cadre du mouvement national Stand Up For Science   , le collectif paris-saclay organise deux conférences-débat sur le campus de l’université : Le mardi 8 avril 2025, 12h30-13h30, amphi A2 du bâtiment 625 (HBAR) sur le plateau. Le jeudi 10 avril 2025, 12h30-13h30, amphi H1 du bâtiment 334 dans la vallée. En visioconference   ((cliquer sur “Rejoindre”)) Certaines sciences sont victimes de graves entraves aux libertés académiques aux Etat-Unis et, de façon plus nuancée, en Europe. Ces attaques remettent en question, au delà des sciences, les notions de démocratie, d’état de droit, de droits de l’homme et de liberté d’information. Les intervenants seront :

Développement de méthodes statistiques pour la méta-analyse d'études d'association pangénomique, applications en génétique des plantes

Thèse menée sous la direction de Tristan Mary-Huard (MIA Paris Saclay, GQE Le Moulon) et Alain Charcosset (GQE Le Moulon). Le jury sera composé de : David Causeur, Professeur - Institut Agro, Université Rennes, CNRS (Rapporteur et Examinateur) Pierre Neuvial, Directeur de Recherche - CNRS, Institut Mathématiques de Toulouse (Rapporteur et Examinateur) Hugues Aschard, Directeur de Recherche - Institut Pasteur, Sorbonne Université (Examinateur) Mathilde Causse, Directrice de Recherche - INRAE, UMR GAFL, Avignon Université (Examinatrice) Andrea Rau, Directrice de Recherche - INRAE, UMR GABI, Université Paris-Saclay, AgroParisTech (Examinatrice) Résumé : Les études d’association pangénomiques (GWAS) permettent d’identifier les régions génomiques associées aux caractères phénotypiques.En génétique végétale, ces GWAS aident à identifier les facteurs génétiques influant des caractères agronomiques essentiels, tels que le rendement, la résistance aux maladies ou la tolérance aux stress environnementaux. Cependant, les GWAS présentent des limites importantes, notamment en termes de puissance statistique car elles analysent des millions de marqueurs génétiques pour un nombre relativement réduit d’individus. De plus, les approches GWAS standard sont généralement limitées à l’étude des associations avec un seul caractère à la fois, ce qui restreint leur capacité à appréhender l’architecture génétique complexe sous-jacente à plusieurs caractères. En génétique humaine, la méta-analyse a été efficacement utilisée pour intégrer les résultats de plusieurs études GWAS et surmonter les limites des approches standards, en permettant d’une part d’améliorer la puissance statistique et d’autre part d’étudier les associations entre plusieurs caractères. Malgré ce potentiel, la méta-analyse n’a été que très peu exploitée en génétique végétale. Dans cette thèse, nous présentons les raisons pour rendant les méthodes existantes de méta-analyse inappropriées aux applications en génétique végétale et introduisons des nouvelles méthodes de méta-analyse adaptées à trois différents contextes clés. Premièrement, nous proposons une méthode de méta-analyse pour étudier les interactions gène-environnement, qui jouent un rôle crucial dans la relation génotype-phénotype chez les plantes. Deuxièmement, nous présentons une approche de méta-analyse pour détecter les variants pléiotropes, qui influencent plusieurs caractères phénotypiques et permettent de mieux comprendre les voies génétiques. Troisièmement, nous introduisons une nouvelle stratégie permettant de détecter les variants génétiques associés à des groupes de caractères moléculaires, tels que l’expression de gènes ou l’abondance de protéines. Les méthodologies développées dans cette thèse reposent sur des modèles à variables latentes, permettant une modélisation flexible des effets génétiques dans différents contextes. En abordant les principales limites des méta-analyses, ce travail offre de nouvelles méthodes statistiques pour les études d’association en génétique végétale, permettant des investigations plus approfondies de l’architecture génétique des caractères complexes.