#Methode
RNA & Proteine aus EINER Probe!
Catherine Bourgouins Team am Pasteur-Institut der Universität Paris hat ein Protokoll entwickelt, welches die Entscheidung, ob #RNA-Seq oder #Proteomik hinfällig macht. Dank Zellaufschluss in Harnstoff &Tris-Puffer und einer erst anschließenden Aliquotierung, kann beides mit einer Probe durchgeführt werden.
Mehr im Artikel von Andrea Pitzschke: https://www.laborjournal.de/editorials/3420.php

#Laborjournal #MultiOmics #Transkriptomik #Malaria #LCMS #InstitutPasteur #Paris

#Special
#RNA-Sequenzierung im Fokus: Von Parasiten über Darmbakterien bis zum Gehirn - Mario Rembold zeigt im Artikel, wie entscheidend die Probenvorbereitung für aussagekräftige RNA-Seq-Daten ist – und das von Einzelzell- und räumlicher Transkriptomik bis zur Long-Read-Sequenzierung langer neuronaler Transkripte:

https://www.laborjournal.de/rubric/methoden/methoden/v316.php

#laborjournal #lifesciences #RNASeq #SingleCell #LongRead #Transkriptomik

@jlugiessen

(2/2) ... Marianne hat sich jetzt die Mühe gemacht, den bislang kaum beachteten PFAS-haltigen Pflanzenschutzmitteln auf den Grund zu gehen. Sie nahm den Bericht einer NGO zum Anlass, an vielen Stellen genauer nachzufragen: bei der Pestizide produzierenden Industrie, bei mehreren zuständigen Ämtern und Behörden in Deutschland und bei der EU. Sie spürte zudem teils gut versteckte Studien nicht nur auf, sondern las sie auch sorgfältig durch. ...

Heute neu: #SporksSciencNews mit #EpigenetikNews: https://9jmt.mjt.lu/nl3/brVRjS412QwkbaVwpQItTA

Dort erfahrt ihr mehr zu #PFAS, #Prävention und der spektakulären Aufklärung der menschlichen Gehirnentwicklung mit #Transkriptomik und #Epigenomik

Jetzt lesen und die #RiffReporter unterstützen. Danke ❤️

Foto: RiffReporter eG

@riffreporter @mariannefalck @martinruecker

Die Analyse von Prozessen in vielen einzelnen Zellen mittels #Genomik, #Transkriptomik, #Proteomik und #Multiomik wird immer umfassender und komplizierter. Unser neues Dossier "#Einzelzellanalyse" hilft mit 21 Artikeln dabei, den Überblick nicht zu verlieren: https://www.laborjournal.de/editorials/3257.php
Nur wenn man die Ergebnisse von #Genomik, #Transkriptomik, #Epigenomik, #Proteomik und #Metabolomik in einer #Multiomik-Analyse integriert, erhält man ein umfassendes Bild vom Zustand einzelner Zellen. Mario Rembold berichtet, wo man damit inzwischen steht: https://www.laborjournal.de/rubric/special/special/2025_03_02.php
Die Multiomik von Einzelzellen integriert Daten verschiedener Omiken

Forschende fassen die Ergebnisse von Genomik, Transkriptomi, Epigenomik, Proteomik und Metabolomik in Multi-Omik-analysen zusammen um ein umfassendes Bild vom Zustand in Einzelzellen zu erhalten

Unser neustes #Dossier:

#Transkriptom-Analyse

15 Artikel zu allen technischen und anderen Feinheiten von #RNAseq und #Transkriptomik – inklusive etwa zu Problemen, wie man einzelne Transkripte in Zellen und Geweben exakt lokalisieren kann.

👉 https://www.laborjournal.de/rubric/dossier/transkriptom.php

Laborjournal online: Dossier - Transkriptom-Analyse

Die Sequenzierung von Transkriptomen ist inzwischen Routine. Viel kniffliger ist es, die einzelnen Transkripte in Zellen und Geweben exakt zu lokalisieren.