🦠 How can #AI help track the spread of #AMR?

New #RKI research in #ScientificReports investigates how combining multiple #ML models can improve detection of genomic islands associated with horizontal gene transfer.

🔗 https://doi.org/10.1038/s41598-026-53037-x

#genomics #genetics

🧬 New publication!

Excited to introduce DupyliCate, an automated tool for the identification, classification, and characterization of gene duplications. Designed for high-throughput analyses across diverse species, it supports comparative genomics and evolutionary studies.

📄 Paper: https://doi.org/10.1038/s41598-026-55350-x

#Genomics #Bioinformatics #EvolutionaryBiology #ScientificReports #OpenScience
@boas_pucker

Internet zbudowany przez naturę. Zaskakujące badania pokazują, jak grzyby reagują na związki chemiczne

Większość z nas postrzega grzyby jedynie przez pryzmat owocników, które po deszczu wystają ponad ściółkę. W rzeczywistości pod naszymi stopami kryją się gigantyczne, podziemne sieci grzybni, które przypominają naturalny internet i nieustannie przekazują sobie sygnały elektryczne.

Japońscy naukowcy postanowili sprawdzić, jak dokładnie działają te kanały, badając ich reakcję na wodę i konkretne związki chemiczne. Wyniki precyzyjnie pokazują, w jaki sposób biologiczna sieć reaguje na zmiany w środowisku.

Elektrody podpięte do leśnej sieci

Badacze z Uniwersytetu Tohoku opublikowali na łamach „Scientific Reports” wyniki fascynującego eksperymentu. Podłączyli oni mikroskopijne elektrody do 37 dziko rosnących grzybów ektomykoryzowych. Ten konkretny rodzaj grzybów charakteryzuje się bardzo dużą wrażliwością na wysokie stężenie amoniaku w glebie. Co ciekawe, w ramach eksperymentu naukowcy jako naturalnego źródła tego związku użyli ludzkiego moczu, chcąc zbadać reakcję sieci na codzienne, organiczne procesy zachodzące w przyrodzie.

Naukowcy potraktowali badane obiekty wodą z kranu oraz wspomnianym źródłem amoniaku, a następnie mierzyli ich sygnały elektryczne. Badania potwierdziły, że przepływ ładunków w biologicznej sieci nie jest przypadkowy – aktywność elektryczna potrafi drastycznie wzrastać lub spadać w zależności od tego, z jakim bodźcem organizm wszedł w kontakt.

Dlaczego podziemny internet nagle milknie?

Zanotowane wyniki obalają mit, że system korzeniowy pulsuje nieprzerwanie i z taką samą intensywnością. Kiedy naukowcy polali wodą tylko jednego grzyba, jego aktywność elektryczna natychmiast wzrosła, co oznaczało zwiększoną aktywność sygnałów płynących do reszty sieci. Kiedy jednak wodę rozlano na znacznie większym obszarze, ogólna aktywność elektryczna spadła. Podobny efekt gwałtownego „wyciszenia” przesyłu sygnałów zaobserwowano po potraktowaniu pojedynczego grzyba amoniakiem.

Skąd bierze się ta wybiórczość? Autorzy badania stawiają prostą i logiczną hipotezę: jeśli bodziec dotyka od razu dużego obszaru, podziemna sieć nie musi przesyłać dalej ładunków, bo wszystkie jej węzły już na niego zareagowały. Oprócz tego naukowcy zauważyli, że na jakość przesyłu danych mocno wpływa również dystans fizyczny oraz stopień pokrewieństwa genetycznego między poszczególnymi grzybami.

Dla nas to nie tylko biologiczna ciekawostka. Rozszyfrowanie sposobu, w jaki rośliny i grzyby reagują na nagłe zmiany chemiczne czy suszę, to klucz do stworzenia rolnictwa przyszłości. W dłuższej perspektywie może to pomóc w projektowaniu naturalnie odpornych upraw, pozwalając ograniczyć zużycie sztucznych nawozów.

Świadomość jako fundament wszechświata. Radykalna teoria fizyczki z Uppsali to nie pseudonauka

AI 창의성의 역설, 평균은 넘었지만 천재는 못 따라간다

https://aisparkup.com/posts/8740

🎉 New paper out in #ScientificReports on how #humans and #MachineLearning can infer the #content of a #conversation based only on the #facial #dynamics of the speakers.

Great work, together with Pras Utama, Johanna Köchling, Jana Straßheim, Britta Renner and Harald Schupp 🙂

"Social context shapes facial dynamics: human and machine decoding of conversation topics"

#OpenAccess

https://www.nature.com/articles/s41598-025-30403-9

WATCH: incredible drone footage shows orcas and dolphins hunting together for the first time

https://fed.brid.gy/r/https://www.upworthy.com/orcas-dolphins-collaborating

New paper out in #ScientificReports on how humans perceive sex-specific #BodyOdours [i.e., #MSH and #HMHA]. It confirms the existence of #gender and #age differences in odour #perception, as well as a pre-existing bias associating #pleasantness with #femininity. However, the effects of the compounds themselves are very small, indicating a minimal role of MSH and/or HMHA in mate preferences.

A combined work with #CamilleFerdenziLemaitre, #GéraldineCoppin and #SylvainDelplanque :-)

#OpenAccess

https://www.nature.com/articles/s41598-025-26457-4