Elle travaille à l'IDEEV : Mélisande Blein-Nicolas, ingénieure de recherche à GQE

Mélisande Blein-Nicolas jongle des protéines aux finances Mélisande Blein-Nicolas, vous êtes ingénieure de recherche INRAE à GQE-Le Moulon   . Quelles sont vos activités ? J’ai de nombreuses activités qui s’inscrivent dans deux missions principales. Ma première mission est d’être responsable scientifique de la plateforme d’analyse protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO)   et responsable locale du site de PAPPSO adossé à GQE-Le Moulon. J’effectue cette mission avec l’aide d’un comité de direction composé de deux autres personnes. Cette mission recouvre de nombreux aspects depuis la définition, avec l’équipe, de l’orientation stratégique et scientifique de la plateforme sur les cinq ans à venir à la gestion financière (la plateforme génère des recettes) et des personnels, en passant par la labellisation et la certification.

Our R package MCQR is published!

MCQR is an R package R package for the in-depth exploration, processing, and analysis of quantitative proteomics data generated from either data-dependent or data-independent acquisition methods. It has been recently accepted for publication in Journal of Proteome research

Des Plantes et des Hommes en visite à GQE-Le Moulon

Dans le cadre du projet Des Plantes et des Hommes, GQE-Le moulon a accueilli en février et mars 2025 plusieurs classes de lycée sur 2 demi-journées.

Journées du Protéome Vert les 26 et 27 mai 2025 au centre INRAe de Dijon, 27 rue Sully.

Journées PROTÉOME VERT des 26 et 27 mai 2025 centre INRAe de Dijon, 27 rue Sully. Les journées Protéome Vert sont ouvertes aux personnes intéressées par la protéomique des plantes. Vous êtes invités à y présenter aussi bien les nouveaux développements méthodologiques dans les domaines de la préparation des échantillons, de la spectrométrie de masse et de l’analyse bioinformatique que les résultats biologiques obtenus grâce à la protéomique. Les journées sont organisées par le réseau Protéome Vert.

i2MassChroQ

i2MassChroQ is a free software (GPL v3) that helps the user filter and group peptide/protein identifications from MS/MS mass spectra; perform area-under-the-peak XIC-based quantification of proteins. i2MassChroQ is fully described in:

Les journées IDEEV 2025 - 1ère journée

Programme détaillé Please bring your own glass/cup/mug and fork, knife and spoon 8:45 : WELCOME COFFEE 9:15 : WELCOME & IDEEV COMMUNITY 9:30 - 10:45 : SESSION 1 Chair : Diala Abu Awad (GQE) 9:30 - 9:40 2 FLASH TALKS Loreleï BOYER (ESE) : Gene loss in the mating-type chromosomes of anther-smut fungi Yuqi NIE (GQE) : On the pear domestication: Insight from Population Genomics 9:40 - 10:40 3 TALKS Raphaël MINGUELLA (GQE) : Using targeted sequencing on DNA pools to characterize haplotypic diversity in maize landraces and compare it with modern varieties Ricardo Rodriguez de la Vega (ESE) : Tempo of degeneration across independently evolved non-recombining regions Ines MATROUGUI (EGCE) : Exploring the determinants of polydnavirus chromosomal integration across hosts-parasitoïd wasps systems 10:40 - 11:15 : COFFEE BREAK 11:15 - 12:30 : SESSION 2 - Chair : Jacqui Shykoff (IDEEV) 11:15 - 11:25 2 FLASH TALKS Lohan VALADARES (EGCE) : The neuroplasticity of division of labour in the leaf-cutting ant Acromyrmex subterraneus Thomas Sylvestre MICHAU (GQE) : Identification of cis-regulatory elements involved in maize response to water deficit 11:25 - 12:30 4 TALKS Alizée DELARUE (EGCE) : Chemosensory evolution at the origin of inquilinism in the bee louse fly (Braula coeca) Mélisande Blein-Nicolas (GQE) : Integration of phenomic, proteomic, and genomic data into a multi-scale network unravels missing heritability for maize response to water deficit Elsa DE FILIPPO (ESE) : Recombination suppression around the mating-type locus in the Schizothecium tetrasporum species complex Kristina PROKINA (ESE) : Refurbishing the marine parasitoid order Pirsoniales with newly (re) described marine and freshwater free-living predators 12:30 - 13:50 : LUNCH BUFFET 13:50 - 14:00 : GROUP PICTURE 14:00 - 15:00 : SESSION 3 - Chair : Kristina Prokina (ESE) 14:00 - 14:10 2 FLASH TALKS Diala Abu Awad (GQE) Frédéric Marion-Poll (EGCE) : High-throughput behavioral tests to monitor feeding choices in drosophila 14:10 - 15:00 3 TALKS Jazmin BLAZ (ESE) Pierre-Olivier MAQUART (EGCE) : Experience of insects as biorefining factories: The case of the Black Soldier Fly Pierre VERON (ESE) : Predicting the time it takes to speciate 15:00 - 15:30 : COFFEE BREAK 15:30 - 16:45 : SESSION 4 - Chair : Pierre VERON (ESE) 15:30 - 15:40 2 FLASH TALKS Ana GUTTIEREZ (ESE) : Living in an arsenic-rich geothermal ecosystem Stéphane Nicolas (GQE) : MineLandDiv project 15:40 - 16:45 4 TALKS Arnaud Le Rouzic (EGCE) : Evolution of gene expression plasticity Elise LUCOTTE (ESE) : Sex chromosome evolution in humans Alice NAMIAS (ESE) : Repeated evolution of HD genes in Microbotryum fungi Bledina DEDE (ESE) : Microbial ecology of geothermally active lakes across a salinity gradient

i2MassChroQ results in ProteoBench

ProteoBench is an open platform for benchmarking proteomics data analysis workflows. There several modules each one focusing on a specific Protomics technic:

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