Everytime I have to create an #SBGN diagram, I go through the same hell of trying out different dedicated applications. Only to end up using #CellDesigner, followed by #Inkscape.

The latest update from the COVID-19 Disease Map consortium is now available as a preprint.

In this work, we show how the map can be used for #modelling of #COVID disease mechanisms and #DrugDiscovery. With new winter waves beginning, there is still much to be done in this field.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.12.17.520865v1?med=mas

#SBGN #DiseaseMaps #SystemsBiology #SystemsMedicine

Так.. Забавно..
RDF* позволяет делать утверждения относительно триплетов целиком. Конечно в RDF тоже была реификация, но она выражалась более громоздко, а в * достаточно одного предиката на триплет.
Это позволяет удобно кодировать биологические пути как в SBGN PD, где RDF триплеты - это реакции, а реификация тогда будет катализом, ингибицией, или стимуляцией этой реакции со стороны катализатора/ингибитора.

#sbgn #rdf #semweb #systemsbiology