elpescaito 
Con este lío del ' Verifactu ' que al final ha quedado en nada, he descubierto una empresa que distribuye software de contabilidad, facturación y administración para Linux (además de Windows y Mac).
Lo estoy probando y la verdad es que está adaptado a la legislación y tiene una versión gratuita completa. Dejo el enlace para quien quiera echarle un vistazo.