Además, creó la primera academia de pintura para mujeres en Europa fuera de un convento, independientemente de las conexiones sociales y artísticas de sus alumnas. Entre ellas se encontraban sus hermanas Barbara y Anna Maria, Veronia Fontana (grabadora en madera) y Lucrezia Scarfaglia.

Se especializó en pintura religiosa y fue la primera mujer en especializarse en pintura histórica, donde las figuras femeninas cobraban un gran protagonismo (como Judit con la cabeza de Holofernes).

Al alcanzar renombre en Europa, fue visitada en el taller por gente llegada desde lejos.

Su muerte se vio envuelta en una gran controversia, ya que se sospechó que fue envenenada por una criada, que había pedido dejar de trabajar para la familia Sirani antes de la muerte de la artista. Sin embargo, al hacerse la autopsia, se reveló que había fallecido por numerosas úlceras estomacales.
Entonces, las culpas recayeron en su padre, por sobrecargarla de encargos.