Christian Meesters

The #Snakemake plugin for #SLURM on #HPC clusters will support JobArrays, soon:

1057691_1 2dcf44cc-+ rule_map_reads_wild+ 32 COMPLETED 0:0
1057691_2 2dcf44cc-+ 32 RUNNING 0:0
1057691_3 2dcf44cc-+ 32 RUNNING 0:0
1057691_4 2dcf44cc-+ 32 RUNNING 0:0
1057691_5 2dcf44cc-+ 32 RUNNING 0:0
1057691_6 2dcf44cc-+ 32 RUNNING 0:0

Hope to do more during next week's #SnakemakeHackathon2026 / #SnakemakeHackathon

Mar 6 at 11:19amWeb
Show threadChristian MeestersMar 6
Turns out, debugging a Python thread pool is a nightmare. 🤔
Show threadSandor Spruit 🇪🇺🇳🇱🇺🇦🇨🇦Mar 6
@rupdecat …just like anything that involves non-determinism and timing 🙃
Show threadChristian MeestersMar 6
@sandorspruit schrikbarend! (Althans, als je begint met een saai en triviaal project en dan ...)
Show threadSandor Spruit 🇪🇺🇳🇱🇺🇦🇨🇦Mar 6

@rupdecat Ik heb eens een project gedaan waarbij data binnen kwam van een paar honderd mobieltjes. Er zat een foutje in mijn code zodat het mis ging als mensen in de bijbehorende app klikten in één specifieke volgorde.

Dat soort dingen zijn vreselijk. Gelukkig gaat de AI dat allemaal oplossen 😉