RenkeSiems

Angesichts der Entwicklungen in den #USA will @ZBMED eine sichere Alternative zu #pubmed aufbauen, falls da der Hahn abgedreht wird. So weit, so gut, jetzt frage ich mich: was wird der genaue Mehrwert zu #EuropePMC sein? Arbeitet man zusammen? Oder heisst digitale Souveränität hier dann leider "Lasst uns das nächste Silo bauen!"

Vielleicht weiß @kuf auch was dazu?

https://www.zbmed.de/ueber-uns/presse/neuigkeiten-aus-zb-med/artikel/infrastruktur-made-in-europe

Infrastruktur made in Europe: Informationsversorgung in Biomedizin und Lebenswissenschaften sichern

Resilienz und Unabhängigkeit der lebenswissenschaftlichen Forschungsinfrastruktur in Europa zu stärken, ist angesichts der Risiken durch die Abhängigkeiten von den US-basierten Informationsdiensten geboten. ZB MED – Informationszentrum Lebenswissenschaften wird daher eine offene, zuverlässige und nachhaltige Alternative zur PubMed-Datenbank entwickeln. Diese alternative Datenbank stellt zum einen die derzeit verfügbaren PubMed-Inhalte bereit, zum anderen wird sie einen technischen und administrativen Rahmen für kontinuierliche Erweiterungen durch neue Publikationen bieten. Ein zentraler Meilenstein für die nachhaltige Verfügbarkeit medizinischer Fachinformationen wurde bereits erreicht: Die aktuellen Inhalte von PubMed sind gesichert und über das ZB MED-Suchportal LIVIVO zugänglich.

ZB MED - Informationszentrum Lebenswissenschaften
May 6, 2025 at 7:16amWeb
Show threadBastianDreesMay 6, 2025
@RenkeSiems @ZBMED @kuf
Ja, es wirkt etwas komisch, dass Europe PMC im Text nicht erwähnt wird. Es wäre interessant zu wissen, in welchem Verhältnis die neue Infrastruktur dazu stehen soll.
Show threadRenkeSiemsMay 6, 2025
@BastianDrees @ZBMED @kuf EMBL arbeitet doch auch mit EuropePMC zusammen, oder erinnere ich das falsch?
Show threadBastianDreesMay 6, 2025
@RenkeSiems @ZBMED @kuf
Europe PMC wird am EMBL-EBI entwickelt und gehostet.
Show threadRenkeSiemsMay 6, 2025
@BastianDrees @ZBMED @kuf Schick!
Show threadanotherfamiMay 6, 2025

@RenkeSiems Eine schöne Frage, die hoffentlich im angekündigten für alle offenen Online-Meeting am 14. Mai 2025 um 15.30 Uhr von irgendwem gestellt werden wird.

Ich werde nicht teilnehmen, da ich mich der Realität eines Antrags bei der DFG nicht gewachsen fühle.

Rechtliche Klärung, kompatible Datenformate, Entwicklung von Open-Source Software-Komponenten, API, Integration weiterer Quellen sowie Pflege und Erweiterung des MeSH klingt doch erstmal gut.

https://www.zbmed.de/ueber-uns/presse/neuigkeiten-aus-zb-med/artikel/einladung-informationsveranstaltung-lebenswissenschaftliche-forschungsinfrastruktur

@ZBMED @kuf

Einladung: Informationsveranstaltung "Resilienz und Unabhängigkeit der lebenswissenschaftlichen Forschungsinfrastruktur"

ZB MED plant, eine offene, zuverlässige und nachhaltige Alternative zur PubMed-Datenbank zu entwickeln.

ZB MED - Informationszentrum Lebenswissenschaften
Show threadKate NyhanMay 6, 2025
@RenkeSiems Please forgive me for jumping in in English - it is too long since I studied German in college!
My understanding is that Europe PMC is subject to an agreement requiring it to remove content ingested from PubMed/PMC if the US National Library of Medicine ever tells it to. So, the builders of a new tool may be trying to avoid that dependency?
Show threadRenkeSiemsMay 6, 2025
@nyhan Okay - that's an important point. Maybe nobody thought of a situation like ours now, when the arrangement was formed. A new service by a new organization would avoid this dependancy and could still work when somebody is cutting the cord completely. But I still think we should cooperate and honour the work already done. And some institutions behind EuropePMC might also give a helping hand to the new initiative?
Show threadKate NyhanMay 6, 2025
@RenkeSiems
Sicherlich, die Errungenschaften von EuropePMC (z.B. preprints, SciLite annotations) sind beeindruckend
Show threadKonrad Förstner 💻🧬🦠May 12, 2025
@RenkeSiems As @nyhan pointed out, every other services is relying on the provision of the metadata by the NLM and is building on top of this. Creating a solution for this is not purely a technical issue but will require negotiations with the publisher what the project will also cover. As stated in the press release this be not a silo at all - code published as open source and very early community engagement (pre proposal submission). And yes, there is exchange with other parties.