Researchers use partitioned local depth (PaLD) to search for patterns within time series transcriptome data

https://academic.oup.com/insilicoplants/article/6/1/diad018/7381013
#Arabidopsis #GRN #PlantScience

New algorithm address the challenge of inferring GRNs from time series transcriptome data. This approach generates cohesive networks with minimal user input, revealing biologically meaningful neighborhoods.
https://doi.org/10.1093/insilicoplants/diad018 #PlantBiology #Transcriptomics #GRN

Besichtigung Vereinswald
Liebe Waldfreund:innen,

mit großer Begeisterung möchten wir von unserem kürzlichen Besuch in unserem zweiten Vereinswald in Westbrandenburg berichten! Es zwar ein kurzer Tag vor Ort in der Natur, aber Gemeinschaft konnte gepflegt werden und ein wenig Müll für unseren Planeten an einen besseren Ort gebracht werden.

https://www.berliner-waldfreunde.de/2025/07/19/besichtigung-vereinswald/
#Allgemein #Brandenburg #feder #glas #grn #mll #sturm #Wald

Gene regulatory network analysis pointed to NFIB as a central hub. It interacts with MEIS2 and TCF4, and drives late-stage enhancer activation. Heterochronic transplants confirmed: maturation competence is sensitive to environmental timing.

#NewsMayerlab #GRN #GeneRegulation #GeneRegulatoryNetwork #Scenic+ #NFIB #Transplantation

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Most #biosynthetic gene clusters remain uncharacterized. @marnixmedema @gillesvanwezel &co integrate #GRN analysis & global expression data to identify desJGH as an operon essential for #biosynthesis of #desferrioxamineB in Streptomyces @PLOSBiology https://plos.io/43UVUPB
🍃 Comparative analysis of #GRN identifies conserved regulators in seed plants
by Donat Wulf, Andrea Bräutigam
https://doi.org/phrb #GRN #PlantScience
🌿 A partitioned local depth algroithm reveals community structure using time series transcriptome datasets
https://doi.org/phq4 #GRN #PlantScience
Is My Blue Your Blue?
Wer nicht gerade von Blau- oder Grünblindheit betroffen ist kann eigentlich ganz gut sagen, was Blau und was Grün ist. Aber ab einem bestimmten Punkt wird es schwierig; ist das noch Cyan oder schon türkis? Testet Eurer Farbensehen auf der Seite "Is My Blue Your Blue?" und schaut, ob ihr zum Durchschnitt gehört, oder voll daneben liegt.
https://labelizer.de/is-my-blue-your-blue/
#Grafik #Blau #Farben #Farbenraten #Grn
Is My Blue Your Blue?

Wer nicht gerade von Blau- oder Grünblindheit betroffen ist kann eigentlich ganz gut sagen, was Blau und was Grün ist. Aber ab einem bestimmten Punkt wird es schwierig; ist das noch Cyan oder schon türkis? Testet Eurer Farbensehen auf der Seite „Is My Blue Your Blue?“ und schaut, ob ihr zum Durchschnitt gehört, oder voll…

Labelizer
💻 🌿 A partitioned local depth algroithm reveals community structure using time series transcriptome datasets
by Maleana G Khoury, Kenneth S Berenhaut, Katherine E Moore, Edward E Allen, Alexandria F Harkey, Joëlle K Mühlemann, Courtney N Craven, Jiayi Xu, Suchi S Jain, David J John, James L Norris, Gloria K Muday
https://doi.org/10.1093/insilicoplants/diad018 #GRN #PlantScience 🧪