Как мы перестали молиться на AI и собрали параноидальный конвейер для МРТ (с открытым кодом)

На каждой второй конференции по медицинскому AI звучит один и тот же сценарий: «Дообучим мультимодальную модель, скормим ей DICOM, и она сама выдаст диагноз». На практике, когда этот скрипт пытается попасть в реальную клинику, начинаются неожиданности. OOM на GPU, врачи не понимают, где галлюцинация модели, а где финальный отчёт, двухгигабайтные NIfTI-исследования рвут таймауты балансировщика. Я какое-то время тоже думала, что главное — это модель. А потом пересмотрела собственный код. У меня уже есть MRI Second Opinion . Но это не нейросеть. Это контур с доменной моделью, конвейером приёма данных, циклом обработки, обязательным врачебным рецензированием, финализацией и отдельным репозиторием с открытым кодом . В медицинском IT модель — не главная проблема. Главная проблема — чтобы между входом и выходом ничего не потерялось и не сломалось.

https://habr.com/ru/articles/1022436/

#mri #dicom #архитектура #typescript #open_source #fda #event_sourcing #медицинское_по #machine_learning #pipeline

Today the much anticipated version 0.9.1 of DICOM-rs is released! DICOM-rs is a Rust implementation of the DICOM standard.

The highlights are support for secure transport connections using TLS, a few API extensions, and a large number of bug fixes.

Despite being a patch release, there is a minor breaking change worth paying attention to if you use `dicom_ul` with the `async` feature. Please file an issue if you encounter some friction when updating DICOM-rs crates in your dependency tree.
https://github.com/Enet4/dicom-rs/releases/tag/v0.9.1

#dicom #rustlang #opensource

Małym drukiem, czyli ograniczenia nowości sprzętowych Apple

Apple zaprezentowało wczoraj nowe monitory Studio Display oraz MacBooki Pro i Air. Niestety, jak to często bywa przy tego typu premierach, wiele istotnych informacji zostało zapisanych na stronach produktowych małym drukiem – a mają one ogromne znaczenie.

Studio Display XDR dla wybranych

Zacznę od najbardziej elektryzującej nowości, na którą sam czekałem od lat: monitora z serii XDR w cenie poniżej 20 000 zł, wyposażonego w ekran mini-LED. Apple rzeczywiście go pokazało, ale jednocześnie ograniczyło jego drugą, kluczową cechę – obsługę odświeżania 120 Hz – wyłącznie do wybranych urządzeń. Jakich?

• Komputery Mac: Modele Maca z czipem M1, M1 Pro, M1 Max, M1 Ultra, M2 i M3 obsługują Studio Display XDR przy maks. 60 Hz. Wszystkie pozostałe funkcje Studio Display XDR są obsługiwane. Pełna lista kompatybilności wygląda tak:
  • 16-calowy MacBook Pro (2021 i starszy)
  • 14-calowy MacBook Pro (2021 i starszy)
  • 13-calowy MacBook Pro (M1, 2020 i starszy)
  • 15-calowy MacBook Air (2023 i starszy)
  • 13-calowy MacBook Air (M1, 2020 i starszy)
  • Mac Studio (2022 i starszy)
  • Mac mini (2020 i starszy)
  • Mac Pro (2023 i starszy)
  • 24-calowy iMac (2021 i starszy)
• iPady: Jednak tylko iPad Pro M5 obsługuje Studio Display XDR z częstotliwością 120 Hz. Wszystkie inne modele iPada będą obcięte na 60 Hz. Pełna lista kompatybilności wygląda tak:
  • iPad Pro (M4 i M5)
  • iPad Pro 12.9-calowy (3. I 6. generacji)
    iPad Pro 11-calowy (1. i 4. generacji)
    iPad Air (M2, M3, and M4), iPad Air (5. generacji)

Czyli komputery z procesorami Apple M4 obsłużą 120 Hz, a ten sam układ w iPadach już nie? Tak – w ten sposób Apple „zachęca” do wymiany sprzętu na nowszy.

Oczywiście można tłumaczyć to różnicami w konfiguracji, na przykład mniejszą liczbą rdzeni GPU w wersjach M4 stosowanych w iPadach w porównaniu z tymi montowanymi w MacBookach czy Macach mini. Ale mimo wszystko – serio, Apple?

Studio Display XDR od Apple z funkcją DICOM do diagnostyki radiologicznej

Nowy Studio Display XDR został zaprojektowany z myślą o profesjonalistach, w tym w medycynie. Co to oznacza?

Monitor obsługuje ustawienia DICOM oraz posiada Medical Imaging Calibrator, dzięki czemu może być używany w diagnostyce radiologicznej bez potrzeby korzystania ze specjalistycznych monitorów medycznych.

Użytkownicy mogą przełączać się między standardowym trybem wyświetlania a trybem radiologicznym. Monitor ma mini-LED z 2 304 strefami wygaszania lokalnego, jasność HDR do 2 000 nitów, kontrast 1 000 000:1, odświeżanie 120 Hz i wysoką dokładność kolorów. Cena startowa wynosi 3 299 USD, a kalibrator oczekuje na zatwierdzenie FDA w USA.

Apple podkreśla, że celem funkcji medycznych jest wspieranie opieki zdrowotnej i poprawa jakości diagnostyki.

Ekologiczne opakowania mieszczą się w domowym koszu na recykling

O ekologii nie zapomniano, rzecz jasna. Apple wprowadza bardziej ekologiczne opakowania dla nowych monitorów Studio Display i Studio Display XDR. Kartony zaprojektowano tak, aby można je było łatwo złożyć i podzielić na mniejsze elementy, które zmieszczą się w większości domowych pojemników na recykling.

Producent podkreśla, że obudowa monitora wykonana jest w 100% z aluminium pochodzącego z recyklingu, a wersje ze standardowym szkłem zawierają aż 80% szkła z odzysku – to pierwszy taki przypadek w historii firmy. Ulepszone modele z powłoką nano-texture nie obejmują tej zmiany.

MacBooki Air

Zasilacze

Każda konfiguracja nowego modelu otrzymuje w standardzie zasilacz 40W Dynamic Power Adapter (z maksymalną mocą 60W), zaprezentowany wcześniej wraz z iPhonem 17 Pro. Niestety – nie w Polsce. U nas nadal dają 30 W w cenie 199 zł.

W poprzednich generacjach MacBooka Air dołączano zasilacz 30W USB-C lub 35W Dual USB-C Port Compact Power, w zależności od konfiguracji. Teraz użytkownicy otrzymują wydajniejszy wariant w standardowym zestawie.

Przy zamówieniach indywidualnych nadal można wybrać alternatywy ale – uwaga po raz drugi – tylko wówczas, gdy wybierzecie droższą o 1000 zł wersję procesora. Inaczej konfigurator nie pozwala dołożyć żadnej ładowarki (nawet tej 30 W!):

• 35W dwuportowy zasilacz USB-C (+319 zł),
• 70W zasilacz USB-C (+319 zł), który umożliwia szybkie ładowanie do 50% w około 30 minut.

MacBook Pro

Klawiatura

Wygląda na to, że Apple zaktualizowało wygląd klawiatury w nowym 16-calowym MacBooku Pro M5.

Etykiety Backspace, Return, Shift i Tab zniknęły, zastąpione symbolami.

Procesory

Apple zmienia nazewnictwo rdzeni CPU w M5: „Performance” staje się „Super”

Apple wprowadziło zaskakującą zmianę w nazewnictwie rdzeni CPU w nowych MacBookach Pro z M5 Pro i M5 Max. Najmocniejsze rdzenie, dotąd nazywane „performance cores”, teraz mają nazwę „super cores”. Zmiana obejmuje także wcześniejsze urządzenia z M5, w tym MacBooki Pro, iPady Pro i Vision Pro.

Dodatkowo Apple odświeżyło konstrukcję rdzeni efektywnościowych. Te dotychczasowe „efficiency cores” zyskały większą wydajność w zadaniach wielowątkowych i są teraz określane jako „performance cores”. W skrócie: rdzeń efektywnościowy stał się wydajnościowym, a wydajnościowy – superrdzeniem.

Zmiana nazewnictwa ma głównie charakter marketingowy – Apple chce podkreślić moc „mniejszych” rdzeni, które dotąd były niedoceniane. Sama modernizacja rdzeni efektywnościowych jest korzystna, bo poprawia osiągi przy codziennych zadaniach i przygotowuje grunt pod przyszłe generacje M6.

W tym samym czasie Apple ogłosiło nową architekturę Fusion, umożliwiającą łączenie różnych „chipletów” w jednym układzie. To krok w stronę bardziej modułowych i elastycznych procesorów, np. w wariantach GPU z 20 rdzeniami (Pro) i 40 rdzeniami (Max), a potencjalnie także przyszłych modeli Ultra.

VTKUnity Medical Volume Vie... #Vtk #Unity #Medicalimageviewer #Medicalimaging #Dicom #Nifti #Nrrd #Metaimage #Vtkxmlimage #Volumerendering #Volumecropping #Slicerendering #Interactivereslicing #Multiplanarreconstruction #Windowlevel #AssetStore

https://u3dn.com/packages/vtkunity-medical-volume-viewer-275516

One thing I’ve never quite understood is the reluctance of certain doctors to provide medical imaging to patients in a digital format.

As someone with interests in photography, programming, data, and my own health, I find the RAW-like DICOM image file format fascinating. So, even if it comes on a CD-R and costs 2500 JPY, I always try to get my own medial imagery whenever possible. (These are also extremely helpful to have in advance if an issue recurs and you need to show the progression to a new clinic.)

I’ve had good luck getting endoscopy, X-ray, and MRI data over the years, but the doctor at the colonoscopy clinic today was a hard no. They’ll only provide the photos they took of the inside of my own body to another doctor, not to me, myself, the subject in question.

(They did provide a printout of a few key moments for my reference. Why this is available when the actual image data is not remains a mystery to me.)

#opendata #DICOM #digitalrights #patientrights #medicalimaging #japan